Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGPEP1LA6NFU8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1LA6NFU8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms