Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms