Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMB4A4D0S4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMB4A4D0S4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms