Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms