Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN16Q9Y5I7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms