Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLF12Q9Y4X4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms