Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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