Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms