Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms