Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms