Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF346Q9UL40 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms