Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms