Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms