Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEFF2Q9UIK5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms