Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms