Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms