Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms