Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSFQ9UBX1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms