Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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