Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms