Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms