Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NINJ2Q9NZG7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NINJ2Q9NZG7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms