Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC25Q9NXE8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms