Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms