Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms