Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms