Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLE3Q9NRF9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms