Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms