Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms