Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms