Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NYXQ9GZU5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NYXQ9GZU5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms