Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP4AQ9BY43 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4AQ9BY43 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms