Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRIP1Q9BX63 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms