Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms