Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC94Q9BW85 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC94Q9BW85 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC94Q9BW85 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC94Q9BW85 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC94Q9BW85 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms