Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms