Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms