Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA1CQ9BQE3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms