Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SH3GL3Q99963 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms