Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP9Q99956 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms