Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms