Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPNE2Q96FN4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE2Q96FN4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms