Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms