Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTP4Q96DX8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms