Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms