Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTHRC1Q96CG8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms