Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM3DQ96BQ1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM3DQ96BQ1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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