Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms