Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms