Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNOT9Q92600 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms